Geenianalytiikka kehittyy nopeasti

Julkaistu 01.12.2011

Geenianalytiikka kehittyy nopeasti

Geeni- eli nukleiinihappotutkimus on soluttautumassa laboratorion eri osa-alueille, todettiin sairaalakemistien koulutuspäivillä Järvenpäässä.

Aiheesta puhuivat HUSLABin geenianalytiikan asiantuntijat: Raisa Loginov kertoi nukleiinihappotutkimuksista kliinisen mikrobiologian laboratoriossa, Soili Kytölä geenitutkimuksesta lääkehoidon valinnan perusteena syövissä, Arto Orpana geenianalytiikan kehityksestä ja Eveliina Salmela geenitesteistä kliinikon apuna.

Nukleiinihappoja voidaan tutkia synnynnäisissä taudeissa, joissa löytyvä geenimuutos tai -muutokset voivat olla taudin aiheuttaja. Tällöin kyseinen geenimuutos on yksilön kaikissa soluissa.

Toisaalta voidaan tutkia somaattisia geenimuutoksia, jotka löytyvät vain tietystä osasta yksilön soluja, esimerkiksi syöpäkasvaimesta.  Syövästä löydetyt geenimuutokset toimivat kliinikon päätösten apuna. Ne voivat paitsi vaikuttaa taudin ennusteeseen, myös määrittää sen hoidon.

Herkkiä molekyyligenetiikan tekniikoita voidaan käyttää myös mikrobiologiassa, kun määritellään näytteessä olevaa mikrobia. Tässä tutkimus kohdistuu ihmisen geenien sijasta mikrobin geeneihin.  Kvalitatiivisissa määrityksessä voidaan tutkia esim. saadaanko aikaan monistustuotetta tietyn mikrobin genomin spesifisti tunnistavilla alukkeilla. Jos syntyy monistustuotetta, näytteessä on kyseinen mikrobi-infektio.

Haaste tietojärjestelmille

Molekyyligenetiikan menetelmät ovat kehittyneet nopeasti. Tavoitteena on saada vastaus asetettuun kysymykseen nopeasti ja luotettavasti.

Tulevaisuudessa arkipäivää on ehkä koko genomin sekvensointi. Lisäksi genetiikan laboratorioissa on myös otettu käyttöön automaatiota esimerkiksi näytteen esikäsittelyssä. Geenianalytiikan kehittyminen heittää haasteen myös tietojärjestelmille, joiden on kehityttävä sen rinnalla.

Koulutuspäivät Järvenpäässä 17.-18.11.2011 järjesti Sairaalakemistit ry.

Teksti ja kuvat Annika Rökman

.

Näkökulma | 29.11.2019

Varo, hakkeri voi varastaa identiteettisi!

Kaikki verkkopalvelut ovat jatkuvasti hyökkäysten kohteena, muistuttaa Mylabin asiakaspäivillä... » Lue lisää
Mylab Puhuu Näkökulma | 13.11.2019

Hyvä käytettävyys ehkäisee poikkeamia

Tietojärjestelmien käytettävyydellä on perinteisesti tarkoitettu käyttömukavuutta. Kun kyse on... » Lue lisää
Mylab Puhuu Näkökulma | 31.10.2019

Laboratorio jalkautuu olohuoneisiin

Eksoten tietohallintojohtaja Toni Suihko näkee, että laboratoriokokeita tulisi ottaa... » Lue lisää
Mylab Puhuu Näkökulma | 23.10.2019

Lähtölaskenta on alkanut

Liiketoiminnan kehitysjohtaja Hannu Honkala kertoi Mylabin asiakaspäivillä, miksi uusien... » Lue lisää
Mylab Puhuu Näkökulma | 01.10.2019

Terveydenhuollon rahoitusta tulisi lisätä, ei leikata

Jos haluamme tarjota väestölle pohjoismaisen tason terveyspalvelut, niiden rahoitus... » Lue lisää
Mylab Nyt Näkökulma | 06.06.2019

HUSin uusi johtaja ei halua hidastaa

Juha Tuominen tuo Helsingin ja Uudenmaan sairaanhoitopiiriin oppeja yksityisestä... » Lue lisää
Näkökulma | 15.05.2019

Voiko kuntien digiyhteistyö onnistua?

Pystyvätkö kunnat tekemään yhteisiä päätöksiä digihankkeissa, vai tarvitaanko tiukempaa... » Lue lisää
Näkökulma | 11.01.2019

Olisiko aika jo kypsä geenivirheiden kantajuusseulonnalle?

Tutkimusprofessori Helena Kääriäinen THL:stä uskoo, että on. Seulonnalla voitaisiin... » Lue lisää
Mylab Puhuu Näkökulma

Miksi sepelvaltimotaudin riskitesti yleistyy niin hitaasti?

Plasman keramidipitoisuus on osoitettu luotettavaksi keinoksi ennustaa, keillä on... » Lue lisää
Näkökulma | 12.11.2018

Uteliaisuus uhkaa tietosuojaa

Jokaisella on oikeus valvoa omien terveystietojensa katselua ja käyttöä.... » Lue lisää
Mylab Puhuu Näkökulma | 23.10.2018

Geenisakset – lääketieteen seuraava läpimurto?

CRISPR-tekniikalla haluttu geeni saadaan vietyä juuri oikeaan paikkaan genomissa.... » Lue lisää
Mylab Nyt Näkökulma | 16.10.2018

Tietokonevirus tai tekninen vika voi saada sairaalan polvilleen

Terveydenhuollon tehokkuus on parantunut tuntuvasti tietojärjestelmien ansiosta. Kun järjestelmä... » Lue lisää
Mylab Nyt Näkökulma | 28.09.2018

Lohkoketju kiinnostaa, mutta hyödyt ovat vielä pimennossa

Nykyisten terveydenhuollon tietojärjestelmien korvaaminen lohkoketjuilla ei ole tutkijoiden mielestä... » Lue lisää
Näkökulma | 12.09.2018

Tekoäly tarkentaa laboratorion diagnostiikkaa

Algoritmi voi jo nyt tunnistaa sairaita soluja ja kudoksia... » Lue lisää
Näkökulma | 24.08.2018

”Älkää pelätkö datan hyödyntämistä!”

Terveydenhuollossa on tiukat vaatimukset potilaiden tietoturvalle ja yksityisyyden suojalle.... » Lue lisää